1535年，西班牙的弗赖·托马斯·德贝尔兰加等人偶然发现了加拉帕戈斯群岛。托马斯1487年出生于西班牙索里亚省的杜罗河畔，是当时的第四任巴拿马主教，受命到秘鲁去，当他乘坐的船于2月23日从巴拿马出发时，在一股强大海流的冲击下，他们被带到了外洋的未知海面，于3月10日发现了加拉帕戈斯群岛中的一个小岛。当时船上的淡水仅剩两天的储量了，水手们乘救生艇登陆，发现岛上栖息着大量的海豹、海龟、能够驮起人的巨龟和长得像毒蛇一样的鬣蜥，但是他们并没有找到淡水，因此就朝20多公里外的另一个较大的岛屿驶去。由于仍然没有起风，他们花了几天的时间才到达那里，水很快就喝完了，不得不忍饥挨饿，包括船上的马也没有草吃。
当托马斯和船员们登上这个岛之后，疯狂地寻找水源，实在渴得不行，就从仙人掌的肥大叶瓣中挤出汁液来喝。最后终于在一块岩石的沟壑里找到了水源。托马斯把它归于上帝的恩赐，因为那天是耶稣受难日，寻水出发前他们曾虔诚地做了弥撒。不过，托马斯永远也不会知道，他们所登上的这个岛屿正是加拉帕戈斯群岛中唯一一座淡水充足的岛屿，它就是今天的圣克里斯托瓦尔岛（SaintCristobal）。
圣克里斯托瓦尔是加拉帕戈斯群岛中一个较大的岛屿，在该岛海拔410米的地方有一个叫做埃尔洪科（El．Junco）的小湖，湖水形成数条溪流顺着该岛南坡的岩石和火山岩流淌，含有丰富矿物质的淡水滋润着圣克里斯托瓦尔的土地，使这里的土壤永葆湿润和肥沃。为这里咖啡的生长提供了最难得的条件。
弗赖·托马斯·德贝尔兰加发现该岛之后的340年，即1875年，一个叫科沃斯的土著人来到了圣克里斯托瓦尔岛上，在这里他建立了哈森达咖啡园，并种植了大约100公顷的阿拉伯波旁咖啡树。由于该种植园地处海拔140米~275米之间，气候相当于内陆915米~1830米间的气候，得天独厚的地理条件很适合高酸度的特硬咖啡豆（SHB）生长，于是这种优质的咖啡在这里安了家。
随着咖啡被全世界的人们饮用，世界咖啡业也朝着批量生产模式发展，而圣克里斯托瓦尔这种规模较小且质量难保的咖啡业便陷入了困境，最终很可能无利可图而放弃。直到20世纪90年代初，冈萨雷斯（Gonzalez）家族买下了哈森达咖啡园。亨博尔特海流（HumboldtCurrent）造成的局部小气候，强烈的赤道阳光和急剧的温度变化（海平面温度为43℃，海拔275米的温度为10℃~16℃）提供了得天独厚的有利条件，促使冈萨雷斯家族扩大了咖啡种植园。冈萨雷斯家族通过对早期土地的开垦，将咖啡种植园的面积又扩大了一倍。
由于加拉帕戈斯群岛在历史进程中的独特作用，厄瓜多尔政府已把该群岛辟为国家公园，不再允许将土地开垦为新的农业用地，而且严禁引进和使用化肥、杀虫剂、除草剂和其他化学制剂，因此加拉帕戈斯群岛所产的咖啡被公认为天然产品
